La biblioteca, creada desde el inicio de la institución, se formó con materiales donados por el Dr. Barbero, se acrecentó con libros propiedad del Dr. Schmidt, de la Dra. Susnik y de otras personas que decidieron aportar al acervo del museo. Hoy además de las donaciones, la biblioteca se mantiene al día gracias a los fondos que le otorga la Fundación La Piedad y al canje con otras instituciones similares del mundo.

Es una biblioteca especializada en Antropología e Historia, si bien cuenta con otras secciones.